為了能很好的進行醫療廢水處理或汙泥中的病原體或（huò）使之滅活而進行的處理過（guò）程。分為廢（fèi）水消毒和汙泥消毒。

　　醫院廢水處（chù）理主要是消毒，即（jí）殺滅病原體。提醒醫院廢水的水質十分複（fù）雜，一般隨著用水量的加大，相應（yīng）的汙染物濃度也越（yuè）來越高，醫院廢（fèi）水處理流程應盡可能設調節池，調節池不但可以調節水量，消滅高峰（fēng）負荷，並可以調節水質，使其處（chù）理（lǐ）效果不會因水質變化而受到幹擾二氧化氯消毒劑的投加點一般選擇在調節池之後。浮選沉澱後經消（xiāo）毒池(由二氧化氯混合發生器製備的消毒劑)進行消（xiāo）毒後，達標排放。自發浮選沉澱池的剩餘汙泥排入調節池，調節池和接觸氧化池的汙泥打入汙泥消化池進行好氧消化處理可達標排放。

　　廢水經提升後進入混凝沉澱池進行混凝沉澱，沉澱池出水進入接觸池（chí）進行消（xiāo）毒，接觸池出水達標排放。調節池、混凝沉澱池、接觸池的汙（wū）泥及柵渣等廢水處理站內產生的垃圾集中消毒外（wài）運。

　　醫療廢水處理的基本方法有三類：物理法和化學法。物理法主要（yào）是針對醫院廢水進行沉澱、分離等操作，這樣的（de）操作並不能達到消菌的目的,但能為後續的消菌處理的操作降汙染（rǎn）負荷。生化法是將廢水和微生物混合（hé）與接觸（chù），利用微生（shēng）物自身發生的生物化學等作用對廢水進行分解。